Datadriven life science
Life science, vetenskapen om allt levande, blir allt mer datadriven. Mängden och komplexitet av forskningsdata producerat inom life science-området har vuxit snabbt under de senaste åren. Idag delas en betydande mängd life science-data öppet inom det globala forskarsamhället. Dessa data kan ha betydelse för utveckling och forskning inom området och kan driva ytterligare upptäckter inom flera områden med betydelse för mänsklig livskvalitet och hälsa, som precisionsmedicin, diagnostik, utveckling av nya läkemedel, veterinärmedicin, växtforskning, bioteknik, evolution, biodiversitet och livsmedelsvetenskap.
Om SciLifeLab Data Platform
För att möjliggöra att svensk datadriven life-scienceforskning når banbrytande resultat behövs tillgång till lämpliga tjänster, verktyg och riktat stöd. SciLifeLab Data Platform fungerar både som en teknisk infrastruktur för datadriven life-scienceforskning och som en webbplats som samlar relevanta tjänster, evenemang och utbildning. Plattformen finansieras av SciLifeLab & Wallenberg National Program for Data-Driven Life Science (DDLS), men är öppen för alla forskare inom svensk life science, också för de utan anknytning till DDLS.
De tjänster som tillhandahålls via SciLifeLab Data Platform följer principerna för Öppen vetenskap, Transparent forskning och FAIR (Findable, Accessible, Interoperable, Reusable), samt eftersträvar god praxis för datahantering genom hela datalivscykeln.
SciLifeLab Data Platform har byggts upp och underhålls av SciLifeLab Data Centre och våra samarbetspartners. Om du har några frågor kring plattformens olika delar, kontakta oss gärna via e-post på datacentre@scilifelab.se eller genom att skicka ett meddelande via vårt kontaktformulär.
Teknisk värdmiljö
SciLifeLab Data Platform kommer att erbjuda en värdmiljö för webbaserade verktyg och databaser som stödjer datadriven life-scienceforskning. Plattformen kommer att kunna hantera beräkningsintensiva applikationer och stora datamängder, och erbjuda en infrastruktur där forskare kan dela sina verktyg effektivt.
Inledningsvis kommer värdmiljön att fokusera på att integrera tjänster som utvecklats av SciLifeLab Data Centre och dess samarbetspartners. I framtiden kommer forskargrupper och organisationer att kunna ansöka om att dela sina verktyg i värdmiljön. Information om ansökningsprocessen och behörighetskriterier kommer att meddelas när tjänsten lanseras. Vissa tjänster, särskilt de som är avsedda för data-producerande enheter, kan ha specifika åtkomstbegränsningar.
Denna tjänst kommer att följa bästa praxis inom datahantering och säkerställa hög efterlevnad av principerna för Öppen vetenskap, Transparent forskning och FAIR.
Läs mer om hur du kan ansöka om värdtjänst
Webbsida
SciLifeLab Data Platform websida är tillgänglig på följande webbplats data.scilifelab.se. Plattformens syfte är att tillgängliggöra och främja tjänster och forskning relaterad till datadriven forskning inom livsvetenskaperna i Sverige, detta inkl. såväl relevanta evenemang, utbildningar som initiativ.
Teamet som arbetar med SciLifeLab Data Platform bidrar till webbsidans innehåll, vår ambition är att innehållet skall skapas i samarbete med forskarsamhället. Vi välkomnar forskarbidrag till webbsidans olika sektioner. Du kan exempelvis föreslå en data notis, ett event, eller en kurs. Vi tar även gärna emot förslag på nya sektioner eller data som inte finns tillgängligt idag.
Kontaktformulär för förslag och bidrag
Organisationerna bakom platformen
SciLifeLab
SciLifeLab är ett nationellt center för molekylära biovetenskaper med fokus på forskning inom hälsa och miljö. Centret kombinerar ledande teknisk expertis med avancerat kunnande inom translationell medicin och molekylära biovetenskaper. Vårt mål är också att bygga en stark forskargruppering kring SciLifeLab genom utbildning och samverkan. SciLifeLab grundades av Karolinska Institutet, Kungliga Tekniska Högskolan, Stockholms universitet och Uppsala universitet. SciLifeLab samarbetar idag med alla stora svenska universitet.
SciLifeLab kombinerar teknisk expertis med avancerad kunskap inom translationell medicin och molekylärbiologi. Forskare i hela Sverige kan använda både de tekniker och den kunskap som finns på SciLifeLab.
Läs mer om SciLifeLab på scilifelab.se.
SciLifeLab Data Centre
Forskningen inom life science blir inte bara alltmer teknikdriven, utan även datadriven. SciLifeLab koordinerar och stödjer aktiviteter under hela datalivscykeln. Detta inkluderar projektplanering, dataproduktion, dataanalys, datadelning, fram till publicering och återanvändning av data, där forskare är beroende av avancerad dataanalys och e-infrastruktur. SciLifeLab Data Centre fokuserar främst på data som genereras av SciLifeLabs infrastrukturplattformar. Vi arbetar för att maximera värdet av de forskningsdata som genereras, möjliggöra för forskning som skapar mervärde, och för att möjliggöra för infrastruktur att tillgängliggöra data. På SciLifeLab Data Centre ser vi data som en av de mest värdefulla resurserna i vår verksamhet. Vi strävar efter att göra data FAIR, att säkerställa att data hanteras enligt principerna för öppen vetenskaplig och att maximera datas värde på lång sig för forskarsamhället och samhället.
Läs mer om SciLifeLab Data Centre på scilifelab.se/data/.
Partnerorganisationer
SciLifeLab Data Platform finansieras av SciLifeLab & Wallenberg National Program for Data-Driven Life Science (DDLS). Totalt har 3,1 miljarder kronor beviljatsfrån Knut och Alice Wallenbergs Stiftelse under en period av 12 år. Syftet med programmet är att utbilda och rekrytera nästa generations forskare inom life science, att skapa en stark forskningsmiljö för kompetenser inom beräkningsvetenskap och datavetenskaplig för life i forskningssamhället. Programmets mål att göra det möjligt för varje forskare att bättre analysera och integrera sina data med de globala dataflödena inom life science. Vidare syftar programmet till att skapa samarbete och interaktion mellan lärosäten, att skapa tvärvetenskapliga samarbeten mellan life science och datavetenskaperna samt skapa partnerskap med industri, hälso- och sjukvård och andra nationella och internationella partners.
